Université d'Alger " BenYoucef BenKhedda"

LABORATOIRE DE BIOCHIMIE GENETIQUE

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Activités Scientifiques

 

Thèmes

Equipe 1 : Laboratoire Central de Biologie CHU BEO

Thème 1 : Constitution d’une banque d’ADN

  •  Extraction de l’ADN

  •  Quantification

  •  Mise en banque à -20°c et à -80°c

Thème 2 : Diagnostic phénotypique (enzymologie et chimie) et génotypique (génétique moléculaire et caryotype) des théraurismoses lysosomiales, des maladies peroxysomales et des mitochondriopathies en périodes post et pré- natales

Thème 3 : le stress oxydant

Syndrome métabolique et stress oxydatif.

Depuis quelques années, le monde des sciences biologiques et médicales, est envahi par un nouveau concept, celui du « stress oxydant », c'est-à-dire d’une situation où la cellule ne contrôle plus la présence excessive de radicaux oxygénés toxiques.

Cette situation est impliquée en tant que cause insidieuse principale dans la génèse de diverses pathologies chronique et leurs complications dégénératives : diabète, cancers, arthrite rhumatoîde, maladies d’Alzheimer, asthme.

Plusieurs travaux ont mis en évidence le role du stress oxydatif en tant que chainon obligatoire, entre l’inflammation et l’athérogénèse.

Dans le cas particulier des diabètiques (type 2) l’hyper-glycémie chronique est le facteur le plus important à l’origine de la formation de radicaux libres ( ROS = Réactive Oxygen Species).

L’objectif est d’essayer d’établir chez les DT2, non encore  compliqués une relation entre le syndrome métabolique et le stress oxydatif.

Pour ce faire, différents statuts seront envisagés : clinique, anthropométrique, glyco-régulation, lipido-athérogène, inflammatoire, fonction rénale, ionique, hépatique et stress oxydatif. Ce dernier sera évalué par le dosage de l’homocystéine, des oligo-éléments impliqués dans le site actif des enzymes anti-oxydantes, le dosage de l’activité des enzymes superoxyde dismutase glutathion peroxydase et catalase.

Une étude génétique (cartographie / SNP) des gènes impliqués dans le DT2, est envisagée en collaboration avec l’équipe du Pr. F. Grigorescu - Dr. Attaoua (IURC-UM1)

Elle concernera les DT2 compliqués et non encore compliqués.

Thème 4 : les hypercholestérolémies familiales chez l’enfant

L’hypercholestérolémie familiale  (HF) est une maladie génétique dominante.

A l’état homozygote c’est une maladie  exceptionnelle  dont la prévalence est estimée à l’étranger  à un pour  un million. En revanche, à l’état hétérozygote , l’HF est  une maladie fréquente  dont la prévalence dans la population générale européenne , est voisine de 1/500. C’est une maladie grave, associée  à un risque élevée de complications cardio-vasculaires  prématurées chez le jeune adulte .

Nous nous proposons de faire un dépistage  de l’HF chez des enfants dont les parents ont des antécédents d’atteintes coronariennes documentées avant l’age de 55 ans chez l’homme et 60 ans  chez la femme , afin de débuter chez eux une prise en charge spécifique au titre  de la prévention  primaire de l’insuffisance coronarienne  précoce .

Thème 5 :

  • Mettre au point des techniques spécifiques de biologie moléculaire.

  • Déterminer les paramètres du  bilan lipidique et les génotypes de l'Apo E dans la maladie d'Alzheimer.

  • Apprécier, ensuite, l'influence du génotype de l'apo E sur la concentration plasmatique des paramètres lipidiques.

  • Explorer l'impact du polymorphisme génétique sur la baisse des fonctions cognitives et contribuer au diagnostic précoce et prédictif de la maladie d’Alzheimer par le génotypage des variants délétères du gène de l’apo E

  • Vérifier la relation entre polymorphisme de l'apolipoprotéine E, comme déterminant génétique du processus neuro-dégénératif.


Equipe 2 : Service  Neurologie CHU BEO

En collaboration avec l’équipe 1

Thème : diagnostic phénotypique et génotypique des :

  • dystrophies myopathiques (Duchenne ; Becker) ; des sarcoglycannopathies (myophathies maghrébines et myopathies des ceintures)

  • dysferinopathies (myopathie de Miyoshi) et des Calpaïnopathies


Equipe 3 : Service Dermatologie CHU BEO

En collaboration avec l’équipe 1

Thème : diagnostic génotypique en périodes post et pré-natales des troubles héréditaires de la kératinisation :

xéroderma Pigmentosum, ichtyoses, kératodermies , épidermodysplasie véruciforme et des trichothiodystrophies


Equipe 4 : Service ORL CHU BEO

En collaboration avec l’équipe 1

Thème : détection précoce parmi les surdités autosomiques récessives, de la forme DFNB1 en vue d’instaurer une correction thérapeutique adéquate et précoce limitant les séquelles :

mise au point d’un centre d’implantation de Cochlée

 


Equipe 5 : Service Médecine Légale CHU Mustapha

En collaboration avec l’équipe 1

Thème : identification d’ossements humains dans le cadre d’investigations nationales et internationales


 Equipe 6 : Service Médecine Interne  CHU BEO

En collaboration avec l’équipe 1

1- Les marqueurs de risque cardio-vasculaire :

a-   facteurs de risques classiques et émergents de l’arthériopathie oblitérante des membres inférieurs

b-   athérosclérose, arthériopathie oblitérante des membres inférieurs et HIV

Objectifs : 

L’athérosclérose est une maladie systémique et ubiquitaire, longtemps asymptomatique.  Elle se révèle souvent par un accident athérothrombotique dans quelque territoire artériel que se soit. Elle est la jonction d’un terrain génétique particulier et de plusieurs facteurs de risque qui participent également à  son entretien et son aggravation. Le diabète, l’hypertension artérielle, le tabagisme, les dyslipidémies, la sédentarité, le syndrome métabolique sont des facteurs de risque classiques dont la responsabilité ne souffre d’aucune ombre. De nouveaux marqueurs dits émergents semblent jouer un rôle aussi important comme la CRP us, l’homocystéine, le CD40 L et le rapport ApoB / ApoA. Par ailleurs, certains situations cliniques sont réputées pour être le réceptacle d’athérosclérose grave, prématurée, et rapidement évolutive. Il s’agit en particulier des maladies de système mais aussi de la maladie HIV.

  •  Objectif principal :

Recenser tous les facteurs de risque cardiovasculaire (FRCV) classiques et émergents chez les sujets infectés par le HIV, atteints d’artériopathies oblitérantes des membres inférieurs, et estimer leur prévalence.

  •  Objectif secondaire :

Étudier l’impact des thérapeutiques spécifiques à chacune de ces deux affections (artériopathie oblitérante des membres inférieurs et HIV), sur les caractéristiques évolutives de ces facteurs de risque.


Equipe 7 : Service Ophtalmologie  CHU BEO

En collaboration avec l’équipe 1

Thème : Mise au point de la prise en charge des pathologies oculaires d’origine génétique :

consultation, formation et tests génétiques (moléculaires et cellulaires)


Equipe 8 : Service Gynécologie-Obstétrique CHU BEO

En collaboration avec l’équipe 1

 Thème :

  • Le diagnostic prénatal

o   Améliorer la prise en charge de la pathologie fœtale en s’appuyant sur un diagnostic précis grâce à des techniques d’exploration fiables et validées

  •   Prise en charge post natale médico chirurgicale des pathologies diagnostiquées en antenatal.

  •   Etablir un conseil génétique dans un but préventif.

 

  •  Diagnostic échographique anténatal des malformations fœtales

  •  Etablir le caryotype fœtal par amniocentèse précoce échoguidée en cas de maladies héreditaires liées au sexe ( hemophylie) ou d’anomaliés morphologiques fœtales à l’échographie.

  •  Pratiquer des microanalyses du sang fœtal par cordosynthése pour le diagnostic.

o   Des hémoglobinopathies : dréponocytose, B thalassimiés homozygotes

o   Des anomaliés chromosomiques

o   Des atteintes infectieuses fœtales : toxoplasmose, rubéole, cytomegalovirus.    

Mots clés :

Diagnostic phénotypique, diagnostic génotypique, diagnostic pré-natal, conseil génétique, empreintes génétiques, thésaurismoses lysosomiales, sphingolipidoses, oligosaccharidoses, neurolipidoses, mucopolysaccharidoses, sulfatidoses, maladies de surcharge, maladies peroxysomales, neuropathies, mitochondriopathies, dystrophies musculaires progressives, maladie de Duchenne, maladie de Becker, sarcoglycannopathie, myopathies maghrébines des ceintures, myopathies distales, calpaïnopathies , connexines, surdités congénitales, épidermodysplasie veruciforme, xéroderma pigmentosum, mal de Méléda, génodermatoses, ichtyose autosomique récessive, déficits de réparation de l’ADN, hydrolases acides, maladie de Heck, banque d’ADN , Athérosclérose, génétique, homocystéine, risque cardio-vasculaire, HIV,  CRPus, CD40L, ApoB, ApoA, génotypage de l’ApoE ; Oculo-génétique , Diagnostic prénatal, prise en charge, malformations fœtales, post natal ; conseil génétique ; préventif ; caryotype fœtal, amniocentèse précoce , héreditaire ; hemophylie ; échographie ; microanalyse ; cordosynthése , hemoglobinopathies , drepanocytose, B thalassémies , chromosomique ; infectieuses , toxoplasmose ; rubéole , cytomegalovirus. , processus neuro-dégénératif , ApoE, Stress oxydant ; syndrome métabolique ; diabète type 2 ; insulino-résistance ; homocysteine, Enfant ,hypercholestérolémie familiale , dépistage , traitement) ; thérapie génique ; implantation cochléaire.